在LED前，熒光蛋白激發(fā)光源常用光源為100w的高壓汞燈（高強度紫外線燈），在LED激發(fā)光源普遍后，就成為熒光蛋白激發(fā)光源的主要光源。LED發(fā)射的單色光位于相對較窄的光譜帶中，半高寬約為10nm-40nm，相對于高壓汞燈，LED激發(fā)光源有幾個重要優(yōu)勢：
1）額定使用壽命可達五萬小時以上，遠遠超過其他光源；
2）整個額定使用壽命期間，其輸出強度保持相對穩(wěn)定，確保激發(fā)；
3）LED啟動和關閉時間短，即開即用，不需要預熱；
4）LED光效高，且亮度連續(xù)可調；
5）體積小、輕便，且為冷光源，彌補汞燈的大功率、發(fā)熱、使用復雜燈問題，大大的降低了熒光蛋白激發(fā)光源使用成本并提高熒光蛋白激發(fā)光源操作的簡便性。
對于熒光蛋白激發(fā)光源來說，尤其是單色激發(fā)的熒光蛋白激發(fā)光源，LED具有非常大的吸引力，例如B波段激發(fā)的熒光探針FLTC/GFP標記的樣板，在藍光LED激發(fā)下了可以獲得非常好的圖像，而廣泛應用于免疫熒光檢測領域。多波段LED光源可選，并可控制每一個LED的亮度，可以實現多波長的選擇激發(fā)，便捷。熒光色：365nm紫光；395nm純藍；455nm藍綠色；505nm綠色:；530nm純綠色；590nm黃色；630nm紅色。
